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針灸有助改善免疫指標。中醫師公會全聯會理事長孫茂峰在一場中醫論壇中指出，現有刊登於期刊的研究顯示，溫針足三里穴，能使中老年人血清中部分免疫指標上調，進而調節老年人免疫功能。

溫針是在刺入穴位的針柄上置艾條並點燃，有溫熱刺激的效果。孫茂峰醫師指出，現有實證研究顯示，針灸確具調節免疫功能效益。

針灸操作手法變化甚多，可用於改善不少疾病。頭皮針常用於改善腦部相關疾病，例如透過合理的刺激可以治療癲癇；頭皮針是刺激位於頭部的穴位，只要醫師遵守作業守則，通常不會有任何安全問題，不過對針有強烈恐懼或體能太差、飢餓的人不會強求針灸，以免發生暈針意外。有時候針刺的過程雖然可能刺破很細微的微血管，但基本上安全無礙。

不過少部分體力極度不佳或對針灸恐懼者可能針刺而暈針或昏倒，發生意外。即使評估可以扎針，對身體稍差、體質偏虛弱的患者，中醫師捻針會較謹慎，避免刺激過重。

至於部分病人因小傷口癒合不易，或本身免疫力異常的特殊情形，醫師必須在針灸前予以詢問或辨別，如果身體狀況太差，有特殊傳染病，則盡量避免施針。

針灸有助調節神經內分泌功能。孫茂峰指出，學者觀察電針、艾灸腎俞穴後，能調節老年受試大鼠的部分激素水準。

體內各種激素的平衡，關係到內分泌功能是否正常運作。孫茂峰醫師表示，動物試驗顯示，針刺與艾灸均能增加老年大鼠垂體及血清中黃體生成素、卵泡刺激素及生長激素的水準，表示針灸可使老年大鼠低下的垂體內分泌水準得到部分恢復。

從激素內分泌調節的角度來看，針灸具更多有潛在效益。例如部分研究顯示，針刺療法可使在夜間分泌的褪黑激素增加，並改善睡眠品質；也能協助維持氣血陰陽的平衡。

研究顯示，針刺療法可使在夜間分泌的褪黑激素增加，並改善睡眠品質人體在昏暗的環境下，腦內松果體會產生褪黑激素；相反的，光線的刺激則會抑制褪黑激素的製造；因褪黑激素可以調節睡眠、清醒節律，故對時差轉換所引起之睡眠障礙亦有治療效果。

現代醫學亦指出，白天人體處於活動狀態，交感神經旺盛，對外的抵抗力較強；夜晚睡眠時則副交感神經功能旺盛，內臟器官處於修復和整頓狀態，針灸對交感與副交感神經失調者也有幫助。